外付け EEPROMに書き込んでいた5bitのデータをデータ・フラッシュに書き込みたいと考えています。
このデータは電源ON時に読み出し、SW押下時に書き替え、電源OFF時に書き込みを行います。
このような仕様の場合、データフラッシュライブラリType04とEEPROMエミュレーションライブラリPack02パッケージのどちらを使うのがよいか教えてください。
（https://www.renesas.com/jp/ja/doc/products/mpumcu/apn/rl78/001/r01an2014jj0100_rl78.pdfは読んだのですが。）
また、EEPROMエミュレーションライブラリPack02パッケージを使ったデータフラッシュに読み書きを行うサンプルコードがあれば教えてください。
チョコです。
単に，データフラッシュを使うだけなら，データフラッシュライブラリType04だけで十分です。
そのうえで，データフラッシュをEEPROMのように使う場合に追加でEEPROMエミュレーションライブラリを使用します。
RL78/L13の「RL78/L13 データ・フラッシュ・メモリを用いた外付けEEPROM IC 機能の取り込み（EEPROMエミュレーション・ライブラリ編）」アプリケーション・ノートが参考になるかもしれません。
アプリケーション・ノートの「1. はじめに」にはFDLとEELの使い分けも説明されていますよ。
さらに，「1.3 FDL とEEL の使い分け」も記載されています。